Details of the microarray

Array name Description Technique Reference
Taxonomic 16S rRNA microarray Taxonomic 16S rRNA microarray for comparison of rhizobacterial community composition. The microarray contains 1033 probes and targets 19 bacterial phyla. - Comparison of rhizobacterial community composition in soil suppressive or conducive to tobacco black root rot disease. Kyselková M, Kopecký J, Frapolli M, Défago G, Ságová-Marecková M, Grundmann GL, Moënne-Loccoz Y. The ISME journal. 2009. Pubmed: 19554036

The following probes are part of the array:

Azira1 (pB-2160), Azama4 (pB-2161), Azama7 (pB-2162), Azama8 (pB-2163), Azobr1 (pB-2164), Azoli1 (pB-2165), Azolibr1 (pB-2166), Rhira1 (pB-2167), Rhira2 (pB-2168), Rhira3 (pB-2169), Rhira7 (pB-2170), Rhizo3 (pB-2171), Rhizo4 (pB-2172), Sino1 (pB-2173), Ochro (pB-2174), Beij2 (pB-2175), Bkmuvian (pB-2176), Bktrop1 (pB-2177), Bktrop2 (pB-2178), Bktrop3 (pB-2179), Bktrop4 (pB-2180), Bkand (pB-2181), Hefri2 (pB-2182), Hefri3 (pB-2183), Hefri4 (pB-2184), Heser1 (pB-2185), Heser3 (pB-2186), Janaga2 (pB-2187), Janaga3 (pB-2188), Jant1 (pB-2189), Acave1 (pB-2190), Acave3 (pB-2191), Acave4 (pB-2192), Conide2 (pB-2193), Delac2 (pB-2194), Delac3 (pB-2195), Delf1 (pB-2196), HyMa2 (pB-2197), Hypal1 (pB-2198), Hypal2 (pB-2199), Aldef5 (pB-2200), Alfae1 (pB-2201), Alfae2 (pB-2202), Alfae5 (pB-2203), Alfae7 (pB-2204), Achrom2 (pB-2205), Achrom3 (pB-2206), Achrom4 (pB-2207), Rasol1 (pB-2208), Chrom4 (pB-2209), Metphi1 (pB-2210), Metphi2 (pB-2211), Metphi3 (pB-2212), MetMet1 (pB-2213), Metvor2 (pB-2214), Metvor3 (pB-2215), Metmic1 (pB-2216), Metmic2 (pB-2217), Metmic5 (pB-2218), Metmic6 (pB-2219), Metmic7 (pB-2220), Metmic8 (pB-2221), Metmic9 (pB-2222), Metsar4 (pB-2223), Metsar5 (pB-2224), Metsar7 (pB-2225), enter5 (pB-2226), enter6 (pB-2227), enter3 (pB-2228), enter4 (pB-2229), Xenem1 (pB-2230), Xenem2 (pB-2231), Xenem3 (pB-2232), Xenem4 (pB-2233), Xenem5 (pB-2234), Xenem6 (pB-2235), Xenem7 (pB-2236), Xebe3 (pB-2237), Pagg5 (pB-2238), Pagg6 (pB-2239), Kgra3 (pB-2240), Raqu2 (pB-2241), RaSef2 (pB-2242), RaSef4 (pB-2243), Serr1 (pB-2244), CitBut1 (pB-2245), CitBut2 (pB-2246), CitBut3 (pB-2247), Eamy4 (pB-2248), Eamy5 (pB-2249), Eper1 (pB-2250), Ptol1 (pB-2251), Pechr10 (pB-2252), Pechr6 (pB-2253), Pechr8 (pB-2254), Sal1 (pB-2255), Sapath3 (pB-2256), Sapath4 (pB-2257), Vibr1 (pB-2258), Franc1 (pB-2259), FraWol1 (pB-2260), Frphi1 (pB-2261), Frphi2 (pB-2262), Frtul3 (pB-2263), Frtul4 (pB-2264), Frtul7 (pB-2265), Psres (pB-2266), Pscit1 (pB-2267), Psflav4 (pB-2268), Pslut1 (pB-2269), Pslut2 (pB-2270), Psole1 (pB-2271), Psole2 (pB-2272), Azovi2 (pB-2273), AzoAzo3 (pB-2274), Azobei (pB-2275), Thio3 (pB-2276), Thio4 (pB-2277), Xant2 (pB-2278), Xano3 (pB-2279), Xano4 (pB-2280), Sten12 (pB-2281), Sten13 (pB-2282), Sten14 (pB-2283), Sten15 (pB-2284), Sten4 (pB-2285), SteXan2 (pB-2286), SteXan3 (pB-2287), Lyso2 (pB-2288), Aesal1 (pB-2289), Aero2 (pB-2290), MyxCor1 (pB-2291), MyxCor11 (pB-2292), MyxCor12 (pB-2293), MyxCor14 (pB-2294), MyxCor15 (pB-2295), MyxCor17 (pB-2296), MyxCor18 (pB-2297), MyxCor19 (pB-2298), MyxCor21 (pB-2299), MyxCor22 (pB-2300), Coralc4 (pB-2301), Coralc8 (pB-2302), Corallc10 (pB-2303), Corallc5 (pB-2304), Corallc6 (pB-2305), Corallc9 (pB-2306), Anmxb5 (pB-2307), Anmxb6 (pB-2308), StigMyx9 (pB-2309), Polyang10 (pB-2310), Polyang2 (pB-2311), Chond2 (pB-2312), Chond5 (pB-2313), Chond6 (pB-2314), Chond7 (pB-2315), un3Chon2 (pB-2316), un3Chon3 (pB-2317), un3Chon5 (pB-2318), un43Chon10 (pB-2319), un43Chon12 (pB-2320), un43Chon13 (pB-2321), un43Chon4 (pB-2322), un43Chon7 (pB-2323), un43Chon8 (pB-2324), un43Chon9 (pB-2325), un4Chon4 (pB-2326), Halian2 (pB-2327), Halian3 (pB-2328), Halian5 (pB-2329), Nancs1 (pB-2330), Nancs7 (pB-2331), Nancs8 (pB-2332), CystbSUB1 (pB-2333), CystbSUB2 (pB-2334), CystArch1 (pB-2335), CystArch2 (pB-2336), CystArch3 (pB-2337), Cystb1 (pB-2338), Cystb3 (pB-2339), Cystb6 (pB-2340), Cystb8 (pB-2341), CystMel2 (pB-2342), CystMel3 (pB-2343), unCyst1 (pB-2344), unCyst2 (pB-2345), unCyst3 (pB-2346), Bac25 (pB-2347), Bacsub12 (pB-2348), Bacsub7 (pB-2349), Bacsub9 (pB-2350), Bacaga2 (pB-2351), Bacaga3 (pB-2352), Bacazo3 (pB-2353), Bacbad2 (pB-2354), Bacbae2 (pB-2355), Bacbae3 (pB-2356), Bacben1 (pB-2357), Baccer2 (pB-2358), Baccer7 (pB-2359), Bac10 (pB-2360), Baccer8 (pB-2361), Baccir1 (pB-2362), Baccir3 (pB-2363), Baccla5 (pB-2364), Baccoa1 (pB-2365), Baccoh2 (pB-2366), Baccoh3 (pB-2367), Baccoh4 (pB-2368), Bacfara1 (pB-2369), Bacfara2 (pB-2370), Bacfor1 (pB-2371), Bacfir5 (pB-2372), Bacfle1 (pB-2373), Bacfun 3 (pB-2374), Bacfun 6 (pB-2375), Bachor1 (pB-2376), Bachrt1 (pB-2377), Bacjeo2 (pB-2378), Bacjeo5 (pB-2379), Bacjeo6 (pB-2380), Backru5 (pB-2381), Bacmac4 (pB-2382), Bacmar1 (pB-2383), Bacmet1 (pB-2384), Bacmet2 (pB-2385), Bacmyc1 (pB-2386), Bacmyc3 (pB-2387), Bacoler1 (pB-2388), Bacpich2 (pB-2389), Bacpich3 (pB-2390), Bacpsc 3 (pB-2391), Bacpsf1 (pB-2392), Bacpsf3 (pB-2393), Bacpum2 (pB-2394), Bacsmi1 (pB-2395), Bacsmi4 (pB-2396), Bacsmi5 (pB-2397), Bacsprt1 (pB-2398), Bacsprt2 (pB-2399), Bacmis9 (pB-2400), Bacved 3 (pB-2401), Bacved 4 (pB-2402), PeBr (pB-2403), Paen5 (pB-2404), Paen6 (pB-2405), Ppop4 (pB-2406), Ppotu (pB-2407), Pnaf1 (pB-2408), Pazma1 (pB-2409), Pbo1maq (pB-2410), Pbo1 (pB-2411), Pbo2 (pB-2412), Paeni7-1 (pB-2413), Palv (pB-2414), Palv2 (pB-2415), Pamy3 (pB-2416), Behi1 (pB-2417), Bchikob2 (pB-2418), Pchfabo1 (pB-2419), Pchib2 (pB-2420), Pchinapi (pB-2421), Pcukoho1 (pB-2422), Pdae1 (pB-2423), Pdae2 (pB-2424), Phon1 (pB-2425), Phon2 (pB-2426), Pkor1 (pB-2427), Pkor2 (pB-2428), Pkol3 (pB-2429), Plac (pB-2430), Plar4 (pB-2431), Plen2 (pB-2432), Pnem1 (pB-2433), Pnem2 (pB-2434), Pnem3 (pB-2435), Pnem4 (pB-2436), Pnem6 (pB-2437), Pnem7 (pB-2438), Pval2 (pB-2439), Pvalnaf (pB-2440), Pvalnafchin2 (pB-2441), Pvel4 (pB-2442), Pvelch1 (pB-2443), Pvelch2 (pB-2444), Pxya (pB-2445), Palgi2 (pB-2446), PalgiG1 (pB-2447), PalgiG3 (pB-2448), Brbac18 (pB-2449), Brbac2 (pB-2450), Brbac3 (pB-2451), Brbac4 (pB-2452), Brbac5 (pB-2453), Brbac6 (pB-2454), Brbac8 (pB-2455), ChryD1 (pB-2456), ChryD2 (pB-2457), ChryD3 (pB-2458), ChryD4 (pB-2459), ChryD5 (pB-2460), ChryD6 (pB-2461), ChryD7 (pB-2462), Chrygl1 (pB-2463), Chrygl3 (pB-2464), Chryme1 (pB-2465), ChrysR (pB-2466), Artb1 (pB-2467), Artb2 (pB-2468), Artb3 (pB-2469), Micco9 (pB-2470), Frank11 (pB-2471), Frank13 (pB-2472), Frank15 (pB-2473), Frank16 (pB-2474), Kisp5 (pB-2475), Kisp6 (pB-2476), Kisp7 (pB-2477), Kisp8 (pB-2478), Kisp9 (pB-2479), Stsp10 (pB-2480), Stsp16 (pB-2481), Stsp19 (pB-2482), Cornba11 (pB-2483), Cornba13 (pB-2484), Cornba5 (pB-2485), Cornba8 (pB-2486), Dietz4 (pB-2487), Dietz6 (pB-2488), Dietz7 (pB-2489), Dietz8 (pB-2490), Sacchps10 (pB-2491), Sacchps14 (pB-2492), Agrm4 (pB-2493), Agrm5 (pB-2494), Agrm7 (pB-2495), MicmFAM13 (pB-2496), MicmFAM15 (pB-2497), MicmFAM6 (pB-2498), Micm3 (pB-2499), Nono1 (pB-2500), Tetsp3 (pB-2501), Terrb1 (pB-2502), Terrb3 (pB-2503), Terrb5 (pB-2504), Terrb7 (pB-2505), Them15 (pB-2506), Them16 (pB-2507), Them17 (pB-2508), Thebi10 (pB-2509), Thebi7 (pB-2510), Bifid5 (pB-2511)