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Details of the microarray

Array name	Description	Technique	Reference
Soil microbial community phylochip	16S rRNA microarray (phylochip) for analysis and comparison of microbial community composition of soils. The microarray is contains 575 probes targeting bacterial diversity at various taxonomic levels from phyla to species.	-	Antibiotic-resistant soil bacteria in transgenic plant fields. Demanèche S, Sanguin H, Poté J, Navarro E, Bernillon D, Mavingui P, Wildi W, Vogel TM, Simonet P. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 2008. Pubmed: 18292221

The following probes are part of the array:

Beta3 (pB-1645), Burcep (pB-1646), Bkhglum (pB-1647), Bkhgram1 (pB-1648), Aceto2 (pB-1571), Aceto3A (pB-1572), Aceto3B (pB-1573), Ace2 (pB-1574), Acidomonas2 (pB-1575), Aceti1 (pB-1576), Asia2 (pB-1577), Acidocella1 (pB-1578), Afipia2 (pB-1579), ACD840 (pB-1580), Acdp821 (pB-1581), Oxy1 (pB-1582), Diaz4 (pB-1583), Gludi (pB-1584), Sac1 (pB-1585), Ruber2 (pB-1586), Glob2 (pB-1587), Bra1 (pB-1588), Lipo1 (pB-1589), Rub1 (pB-1590), Rub2 (pB-1591), Orienta3 (pB-1592), Orienta5 (pB-1593), Hypho3 (pB-1594), Mari1 (pB-1595), Para1 (pB-1596), Undic2 (pB-1597), Sphingo4 (pB-1598), Sub1 (pB-1599), Cap1 (pB-1600), Caulo1A (pB-1601), Caulo1B (pB-1602), Caulo2 (pB-1603), Caubact1 (pB-1604), Asti1 (pB-1605), Bre1 (pB-1606), Rzbc1247 (pB-1607), Rzbc820 (pB-1608), AgroAT41m (pB-1609), AgrRubi (pB-1610), Vit2 (pB-1611), C58-1007 (pB-1612), AgrLarry (pB-1613), AF310-1010 (pB-1614), Rhizo1A (pB-1615), Rhizo1B (pB-1616), Gal (pB-1617), Galli1 (pB-1618), Rhihain (pB-1619), Sino2 (pB-1620), Xinji (pB-1621), Kummero2 (pB-1622), Adh (pB-1623), Barto1 (pB-1624), Bruce3B (pB-1625), Ochro2 (pB-1626), Ochro3 (pB-1627), Phyllobact (pB-1628), Msrhuak (pB-1629), Methylocyst1 (pB-1630), Methy5 (pB-1631), Methy7 (pB-1632), Nitrobacte (pB-1633), Rhodopseud (pB-1634), Elk1 (pB-1635), Nitro1 (pB-1636), Blastobact (pB-1637), Hypho5 (pB-1638), Blastochlo6 (pB-1639), Pedo2 (pB-1640), Cau2 (pB-1641), Methylobact2 (pB-1642), BET940 (pB-1643), Beta2 (pB-1644), Bkhgram2 (pB-1649), Bkhvand (pB-1650), Thau2 (pB-1651), Ni2 (pB-1652), Nitcom2b (pB-1653), Nitcryo1 (pB-1654), Nitcryo2 (pB-1655), Nithalo1 (pB-1656), Nithalo2 (pB-1657), Nitmar2 (pB-1658), Comtes2 (pB-1659), RhizoLCSA1 (pB-1660), Alca1b (pB-1661), Eikcor1 (pB-1662), Methphi5 (pB-1663), Car1 (pB-1664), ACT465a (pB-1665), Thio2 (pB-1666), Mor1 (pB-1667), Psy1 (pB-1668), marino (pB-1669), Ocea1 (pB-1670), Ocea2 (pB-1671), Methy1A (pB-1672), Methy1B (pB-1673), Methmo6 (pB-1674), Met1 (pB-1675), Methmi3 (pB-1676), Ecoli1b (pB-1677), Bren2 (pB-1678), Buch1 (pB-1679), Ewin1 (pB-1680), Kleb1 (pB-1681), Rah1 (pB-1682), Ser1 (pB-1683), Yer1 (pB-1684), Cardio1 (pB-1685), Cyclo5 (pB-1686), Fran (pB-1687), PseuAlc3 (pB-1688), Pseu11 (pB-1689), Pseu19 (pB-1690), Pseu24 (pB-1691), Pseu12 (pB-1692), Pseu15 (pB-1693), PseuStu1 (pB-1694), Pseu33 (pB-1695), PseuTol (pB-1696), PseuSV5 (pB-1697), PseuBC4-6 (pB-1698), PseuISO1-2 (pB-1699), PseuSag1 (pB-1700), Pseu34 (pB-1701), Pseu35 (pB-1702), Pseu36 (pB-1703), NmV (pB-1704), Nitmob (pB-1705), Allo1 (pB-1706), Allo4 (pB-1707), Chrom1 (pB-1708), Thio3H (pB-1709), Thiocys2 (pB-1710), alter1 (pB-1711), alter2 (pB-1712), psalter1 (pB-1713), psalter2 (pB-1714), Xancam (pB-1715), Lysant (pB-1716), Geo1A (pB-1717), Geo1B (pB-1718), DVLVT222f (pB-1719), DVGL228e (pB-1720), Ep1 (pB-1721), Epsi1 (pB-1722), Epsi3 (pB-1723), Alvi2 (pB-1724), Alvi3 (pB-1725), Alvi4 (pB-1726), Alvi5 (pB-1727), Arco1 (pB-1728), Arco2 (pB-1729), Sulfu1 (pB-1730), Sulfu3 (pB-1731), Heli2 (pB-1732), Heli4 (pB-1733), Heli5 (pB-1734), Heli6 (pB-1735), HeliFel1 (pB-1736), HeliMur1 (pB-1737), HeliPull1 (pB-1738), HelPull3 (pB-1739), HeliPyl2 (pB-1740), HeliPyl3 (pB-1741), Wolin2 (pB-1742), Anab1 (pB-1743), nostoc3 (pB-1744), Calo1 (pB-1745), Calo2 (pB-1746), cylindro2 (pB-1747), cylindro3 (pB-1748), gloe2 (pB-1749), lyng2 (pB-1750), micys1 (pB-1751), micys2 (pB-1752), micys3 (pB-1753), oscil1 (pB-1754), phor2 (pB-1755), pleur1 (pB-1756), pleur2 (pB-1757), pleur3 (pB-1758), prochlo1 (pB-1759), prochlo2 (pB-1760), Systic2 (pB-1761), thia1 (pB-1762), tricho2 (pB-1763), tricho3 (pB-1764), chlorob1 (pB-1765), Bacil16 (pB-1766), Bacil60 (pB-1767), Bacsub2 (pB-1768), Bacmega1 (pB-1769), BaCoa1 (pB-1770), Paeni4-2 (pB-1771), Paeni1-2 (pB-1772), Paeni7-2 (pB-1773), Paeni7-3 (pB-1774), Paeni5-2 (pB-1775), Lacto1 (pB-1776), Lacto10 (pB-1777), Lacto15 (pB-1778), Lacto26 (pB-1779), Lacto39 (pB-1780), Lacto41 (pB-1781), Lacto42 (pB-1782), Lacto60 (pB-1783), Lacto61 (pB-1784), Lacto73 (pB-1785), Lacto87 (pB-1786), Lacto90 (pB-1787), Lacto108 (pB-1788), Lacto99 (pB-1789), Enter2 (pB-1790), Lactococcus4 (pB-1791), Strepto1 (pB-1792), Strepto10 (pB-1793), Strepto19 (pB-1794), Strepto27 (pB-1795), Tab993 (pB-1796), buty1 (pB-1797), Sele1 (pB-1798), Sele4 (pB-1799), Sele13 (pB-1800), Sporo2 (pB-1801), Acida2 (pB-1802), Acida4 (pB-1803), Diali3 (pB-1804), Diali5 (pB-1805), Diali14 (pB-1806), Mega2 (pB-1807), Mega4 (pB-1808), Mega8 (pB-1809), Mega11 (pB-1810), Phasco4 (pB-1811), Phasco8 (pB-1812), Eubac3 (pB-1813), Eubac4 (pB-1814), Mogi1 (pB-1815), Mogi12 (pB-1816), Myco11 (pB-1817), Myco2 (pB-1818), Myco43 (pB-1819), Myco57 (pB-1820), Myco81 (pB-1821), Spiroplas2 (pB-1822), Spiroplas4 (pB-1823), Spiroplas15 (pB-1824), Achol3 (pB-1825), Plancto1 (pB-1826), Plancto16 (pB-1827), Plancto17 (pB-1828), Plancto10 (pB-1829), Plancto13 (pB-1830), Plancto14 (pB-1831), Plancto15 (pB-1832), Plancto9 (pB-1833), Plancto12 (pB-1834), Verru4 (pB-1835), Prevo3 (pB-1836), Bacte7 (pB-1837), Rik6 (pB-1838), Porp15 (pB-1839), Dysg3 (pB-1840), Flavo2 (pB-1841), Berg3 (pB-1842), Ornit3 (pB-1843), Ornit7 (pB-1844), Psyf15 (pB-1845), Psys2 (pB-1846), Chrys2 (pB-1847), Blatta1 (pB-1848), Blatta2 (pB-1849), Sapro1 (pB-1850), Sapro2 (pB-1851), Cyclo1 (pB-1852), Hyme3 (pB-1853), Hyme16 (pB-1854), Micro2 (pB-1855), Micro14 (pB-1856), Run4 (pB-1857), Spiro5 (pB-1858), Spiro7 (pB-1859), Spiro10 (pB-1860), Rhodo3 (pB-1861), MPA60 (pB-1862), Actino4 (pB-1863), Arthro-clustB3 (pB-1864), StreptomycesA6 (pB-1865), StreptomycesB3 (pB-1866), StreptomycesC7 (pB-1867), StreptomycesC17 (pB-1868), StreptomycesD7 (pB-1869), Corybo1 (pB-1870), Corybo2 (pB-1871), Coryglu1 (pB-1872), Coryjei1 (pB-1873), CoryVar1 (pB-1874), Coryxer1 (pB-1875), Coryxer2 (pB-1876), Noc1 (pB-1877), Noc2 (pB-1878), NocAfri1 (pB-1879), NocBra1 (pB-1880), NocBra2 (pB-1881), Agroco5 (pB-1882), Agro-clustA3 (pB-1883), CurtoA1 (pB-1884), Frigori2 (pB-1885), MicrobacA1 (pB-1886), MicrobacB4 (pB-1887), NocardioA5 (pB-1888), NocardioB2 (pB-1889), Propio1 (pB-1890), ActiA4 (pB-1891), ActiB4 (pB-1892), ActiC4 (pB-1893), ActiC5 (pB-1894), ActiD2 (pB-1895), Actiba1 (pB-1896), Actiba3 (pB-1897), Actino1 (pB-1898), Thermobifida1 (pB-1899), Nocardio1 (pB-1900), Nocardio3 (pB-1901), ThermonoA18 (pB-1902), ThermonoA8 (pB-1903), ThermonoB1 (pB-1904), ThermonoB3 (pB-1905), Spha5 (pB-1906), Denitro6 (pB-1907), Collin29 (pB-1908), Collin43 (pB-1909), Got625 (pB-1910), Pet454 (pB-1911), AcidUnc (pB-1912), AcidoUnc3 (pB-1913), GeoHolo2 (pB-1914), RhizoLCSA2 (pB-1915), RhizoLCSA3 (pB-1916), RhizoLCSA4 (pB-1917), RhizoLCSA6 (pB-1918), Chlam (pB-1919), OP11-2 (pB-1920), OP11-3 (pB-1921), OP11-4 (pB-1922), OP11-5 (pB-1923), GeoVib1 (pB-1924), Flex3 (pB-1925), Flex5 (pB-1926), Flex6 (pB-1927), OP2_1 (pB-1928), Chloroplast (pB-1929), Muco (pB-1930)