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Probes/primers found for taxon: Enterococcus
Hit typeShort nameName (Alm et al.)Specificity
ExactCGFEnterococcus casseliflavus, E. gallinarum, E. flavescens
ExactEacdfg57Enterococcus casseliflavus, E. flavescens, E. asini, E. dispar, E. gallinarum
ExactEampr18Enterococcus avium, E. malodoratus, E. pseudoavium, E. raffinosus
ExactEamprs09Enterococcus avium, E. malodoratus, E. pseudoavium, E. raffinosus, E. sulfureus
ExactECC460 (ECC 461)Enterococcus columbae, Enterococcus cecorum
ExactEcc461Enterococcus columbae, E. cecorum
ExactEcf459Enterococcus casseliflavus, E. flavescens, E. dispar, E. pseudoavium
ExactECG192 (ECG 191)Enterococcus gallinarum, Enterococcus flavescens, Enterococcus casseliflavus
ExactEcoce58Enterococcus cecorum, E. columbae
ExactEdfm57Enterococcus durans, E. faecium, E. mundtii
ExactEduhi09Enterococcus durans, E. hirae
ExactEma58Enterococcus malodorans
ExactENC1249Enterococcus saccharolyticus, E.dispar, E.casseliflavus, E.faecium, E.flavescens, E.gallinarum, E.columbae, E.sulfureus
ExactEnc1259Enterococcus spp.
ExactEnc131Enterococcus spp.
ExactEnc145Enterococcus spp.
ExactENC90 (ENC 91)Enterococcus faecium, E.mundtii, E.hirae
ExactEnc93Enterococcus hirae, E. faecium
ExactEnter2Enterococcus
ExactEsa38Enterococcus asini, E. saccharolyticus
ExactEsasu58Enterococcus sulfureus, E. saccharolyticus
ExactEsasu58iEnterococcus saccharolyticus, Enterococcus sulfureus
ExactFMDUREnterococcus faecium, E. durans
SpecASIEnterococcus asini
SpecAVIEnterococcus avium
SpecCECEnterococcus cecorum
SpecCOLEnterococcus columbae
SpecDISEnterococcus dispar
SpecDUREnterococcus durans
SpecEas09Enterococcus asini
SpecEav58iEnterococcus avium
SpecEca18iEnterococcus casseliflavus
SpecEca58Enterococcus casseliflavus
SpecEcafl09iEnterococcus casseliflavus, E. flavescens
SpecEce09Enterococcus cecorum
SpecECE83 (6B)Enterococcus cecorum
SpecECE91 (ECE 92)Enterococcus cecorum
SpecEce92Enterococcus cecorum
SpecEcg191Enterococcus casseliflavus, E. flavescens
SpecEco09iEnterococcus columbae
SpecEDI130 (EDI 131)Enterococcus dispar
SpecEdi131Enterococcus asini
SpecEdi137Enterococcus dispar
SpecEdi38Enterococcus dispar
SpecEdr58Enterococcus durans
SpecEdu58Enterococcus durans
SpecEFA-1Enterococcus faecium ATCC 19434 GenBank no. (GI) 5578754
SpecEFA-2Enterococcus faecium ATCC 19434 GenBank no. (GI) 5578754
SpecEFA-3Enterococcus faecium ATCC 19434 GenBank no. (GI) 5578754
SpecEfa54Enterococcus faecalis
SpecEfi58Enterococcus faecium
SpecEfl58iEnterococcus flavescens
SpecEfm09Enterococcus faecium
SpecEfsEnterococcus faecalis FAIR E 92
SpecEfs129Enterococcus faecalis
SpecEga09Enterococcus gallinarum
SpecEhr58Enterococcus hirae
SpecEma58iEnterococcus malodoratus
SpecEmu58Enterococcus mundtii
SpecEMU87Enterococcus mundtii
SpecENC1249-CompEnterococcus malodoratus, E.avium, E.pseudoavium, E.raffinosus, E.durans, E.mundtii, Lb.brevis, Cb.brevisimilis, Cb.divergens
SpecEnc38iEnterococcus spp., Melisococcus spp., Tetragenococcus spp., Vagococcus spp.
SpecEps58Enterococcus pseudoavium
SpecEra58Enterococcus raffinosus
SpecEsa09Enterococcus saccharolyticus
SpecEsa452Enterococcus saccharolyticus
SpecESA88 (ESA 89)Enterococcus saccharolyticus
SpecEso18iEnterococcus solitarius
SpecEso193Enterococcus solitarius
SpecEso58Enterococcus solitarius
SpecEsoha57Enterococcus solitarius, Tetragenococcus halophilus
SpecEsu18Enterococcus sulfureus
SpecEsu90Enterococcus sulfureus
SpecHIREnterococcus hirae
SpecMALEnterococcus malodoratus
SpecMUNEnterococcus mundtii
SpecPSEEnterococcus pseudoavium
SpecRAFEnterococcus raffinosus
SpecSACEnterococcus sacharolyticus
SpecSOLEnterococcus solitarius
SpecSULEnterococcus sulfureus
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